Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP5P45974 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP5P45974 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP5P45974 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP5P45974 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP5P45974 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP5P45974 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP5P45974 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP5P45974 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP5P45974 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP5P45974 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms