Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRATP43155 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRATP43155 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CRATP43155 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CRATP43155 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CRATP43155 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRATP43155 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRATP43155 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms