Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTTP42858 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTTP42858 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTTP42858 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTTP42858 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTTP42858 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTTP42858 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTTP42858 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTTP42858 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTTP42858 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTTP42858 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTTP42858 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTTP42858 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTTP42858 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HTTP42858 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms