Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms