Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN4AP35499 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCN4AP35499 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4AP35499 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4AP35499 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4AP35499 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4AP35499 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4AP35499 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4AP35499 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN4AP35499 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms