Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD12P35452 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms