Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
THBS4P35443 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
THBS4P35443 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
THBS4P35443 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THBS4P35443 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THBS4P35443 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THBS4P35443 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THBS4P35443 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THBS4P35443 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THBS4P35443 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THBS4P35443 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THBS4P35443 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
THBS4P35443 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
THBS4P35443 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms