Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms