Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX1P32242 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX1P32242 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX1P32242 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX1P32242 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX1P32242 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX1P32242 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX1P32242 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX1P32242 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX1P32242 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX1P32242 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX1P32242 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX1P32242 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX1P32242 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX1P32242 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX1P32242 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX1P32242 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX1P32242 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX1P32242 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX1P32242 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX1P32242 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX1P32242 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX1P32242 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX1P32242 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX1P32242 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX1P32242 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms