Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKARP32238 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms