Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA11P31270 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA11P31270 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA11P31270 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA11P31270 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA11P31270 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA11P31270 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA11P31270 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA11P31270 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms