Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5AP29375 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5AP29375 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms