Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DNMT1P26358 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms