Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTX3P26022 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTX3P26022 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTX3P26022 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTX3P26022 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTX3P26022 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms