Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO1P25800 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO1P25800 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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