Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1P21675 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1P21675 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1P21675 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1P21675 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1P21675 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1P21675 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1P21675 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1P21675 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1P21675 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1P21675 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1P21675 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1P21675 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1P21675 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1P21675 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1P21675 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1P21675 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1P21675 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1P21675 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1P21675 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms