Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC1P18754 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC1P18754 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC1P18754 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC1P18754 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC1P18754 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC1P18754 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC1P18754 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC1P18754 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC1P18754 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC1P18754 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms