Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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PTPRAP18433 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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