Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPI1P17947 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms