Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms