Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA4P12838 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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