Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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