Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3P10147 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3P10147 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3P10147 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3P10147 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3P10147 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3P10147 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3P10147 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3P10147 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL3P10147 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms