Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI3P10071 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI3P10071 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI3P10071 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI3P10071 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI3P10071 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI3P10071 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms