Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGB3P0DN86 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms