Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF888P0CJ79 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms