Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXB7P09629 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms