Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLK3P07288 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLK3P07288 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLK3P07288 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLK3P07288 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLK3P07288 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLK3P07288 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLK3P07288 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLK3P07288 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms