Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL2A1P02458 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms