Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F13A1P00488 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F13A1P00488 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13A1P00488 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13A1P00488 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
F13A1P00488 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
F13A1P00488 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13A1P00488 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13A1P00488 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F13A1P00488 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms