Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms