Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRMUO75648 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRMUO75648 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRMUO75648 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRMUO75648 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRMUO75648 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRMUO75648 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRMUO75648 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRMUO75648 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRMUO75648 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRMUO75648 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms