Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms