Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSCO60682 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MSCO60682 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSCO60682 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSCO60682 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSCO60682 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSCO60682 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSCO60682 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSCO60682 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSCO60682 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSCO60682 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSCO60682 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSCO60682 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSCO60682 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSCO60682 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSCO60682 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSCO60682 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSCO60682 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSCO60682 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSCO60682 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSCO60682 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSCO60682 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSCO60682 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSCO60682 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms