Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYNGR3O43761 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms