Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNQ3O43525 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ3O43525 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms