Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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HOXA3O43365 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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HOXA3O43365 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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HOXA3O43365 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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