Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRTM2O43300 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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