Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms