Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VGFO15240 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VGFO15240 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VGFO15240 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VGFO15240 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VGFO15240 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VGFO15240 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VGFO15240 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VGFO15240 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VGFO15240 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VGFO15240 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VGFO15240 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VGFO15240 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VGFO15240 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGFO15240 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGFO15240 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VGFO15240 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VGFO15240 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VGFO15240 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VGFO15240 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VGFO15240 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VGFO15240 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VGFO15240 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VGFO15240 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VGFO15240 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VGFO15240 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VGFO15240 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VGFO15240 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VGFO15240 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VGFO15240 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VGFO15240 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VGFO15240 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VGFO15240 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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