Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF646O15015 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF646O15015 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF646O15015 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF646O15015 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF646O15015 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF646O15015 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF646O15015 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF646O15015 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF646O15015 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF646O15015 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF646O15015 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF646O15015 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms