Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms