Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIP1O00291 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIP1O00291 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms