Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVH48-1M5A8F1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms