Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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