Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E9PBE3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E9PBE3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E9PBE3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E9PBE3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E9PBE3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E9PBE3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E9PBE3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E9PBE3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E9PBE3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E9PBE3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E9PBE3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E9PBE3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.6 ms