Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms