Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH2D7A6NKC9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms