Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMX3A6NHT5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms