Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms